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細胞系STR鑒定的標準和數(shù)據(jù)庫資源

時間:2025/10/11閱讀:333
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為什么進行細胞系STR鑒定?

細胞系STR鑒定主要用于確保細胞身份的準確性和純度,避免因交叉污染或錯誤使用細胞系導致實驗結果偏差。之前一些已經(jīng)發(fā)表的期刊的文章也曾使用了錯誤的細胞品系,導致實驗結果的偏差。ATCC等國際機構將STR鑒定作為細胞鑒定的標準方法,要求實驗室在發(fā)表文章前必須完成鑒定。一些重要的期刊也要求提供細胞鑒定的報告。

 

細胞系鑒定相關的組織、機構以及標準

ANSI/ATCC ASN-0002-2011由美國國家標準學會 US-ANSI 發(fā)布于 2011,標準設立了人類細胞系身份認證檢測的最佳方法,ANSI/ATCC ASN-0002-2021版本是其更新版本。

ATCC成立于1925年,是一家非盈利生物標準品資源中心。ATCC向全球發(fā)布其獲取、鑒定、保存及開發(fā)的生物標準品。

國際細胞系身份認證委員會(ICLAC,The International Cell Line Authentication Committee)是2012年成立的組織,該組織建立有網(wǎng)站,用于登記交叉污染細胞及錯誤鑒定的細胞。強化大家使用正確細胞的認識,促進細胞身份認證檢測開展,減少及至杜絕錯誤細胞的使用。

細胞系品系相關網(wǎng)站,Cellosaurus 網(wǎng)站2025年8月更新的資料顯示包含122193 human細胞系, 30558 小鼠細胞系, 3191 大鼠細胞系的信息。

以上組織、機構、網(wǎng)站在細胞系的鑒定和認證、查詢方面起了重要的作用,在細胞鑒定領域做出了很大的貢獻,并且與時俱進不斷的更新數(shù)據(jù)。

 

什么情況下需要做細胞系鑒定?

1)實驗室剛購買的細胞系;

2)新構建的細胞系;

3)來源可疑的細胞系;

4)實驗項目開始前;

5)細胞系長期凍存后,準備再次使用前;

6)細胞系傳代次數(shù)超過5代以上;

7)文章發(fā)表投稿前;

8)細胞系表型出現(xiàn)異常變化

 

細胞系鑒定時交叉污染確認

細胞品系STR鑒定不但可以確認細胞系的身份,也能在檢測中發(fā)現(xiàn)是否存在交叉污染,一般來說,若STR分型圖譜兩個以上的STR位點同時出現(xiàn)了多等位基因的現(xiàn)象,提示細胞系可能存在交叉污染,當然特殊細胞系除外。

 

人源和鼠源細胞系STR鑒定相關的位點

人源細胞系STR鑒定比對的核心位點數(shù)量是9個或13個,包含了很多STR位點,ANSI/ATCC ASN-0002-2011標準中包含9個位點:Amelogenin、CSF1PO、D5S818、D7S820、D13S317、D16S539、TH01、TPOX、vWA,其中Amelogenin是性別相關的位點。更新的ANSI/ATCC ASN-0002-2021標準中包含了13個位點:CSF1PO、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、FGA、TH01、TPOX、vWA,不包含Amelogenin位點,但是也將Amelogenin作為性別相關的位點。翼和生物檢測的位點更多,包括Amelogenin位點和其他的20個相關位點。除了上述的13個位點之外,翼和生物檢測的STR位點還包括D1S1656、D2S1338、D6S1043、D12S391、D19S433、Penta D、Penta E 這7個額外的位點,提升了人源細胞的鑒定能力。

鼠細胞系STR鑒定一般來說位點數(shù)量是8個或18個,一般說來包含8個STR位點:4-2、6-4、6-7、5-5、12-1、18-3、15-3、X-1。18個位點則是在以上基礎上增加10個位點:1-1、2-1、17-2、11-2、8-1、19-2、7-1、1-2、13-1、3-2 位點。翼和生物檢測鼠源細胞的18個STR位點,提升了鼠來源細胞的鑒定能力。

 


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