MRM（多反應(yīng)監(jiān)測）與PRM（平行反應(yīng)監(jiān)測）是靶向定量蛋白組學(xué)的核心技術(shù)，依托質(zhì)譜“精準(zhǔn)選離子-特異性碎裂-定量分析”邏輯，實現(xiàn)復(fù)雜生物樣本中目標(biāo)蛋白的高靈敏、高特異定量，廣泛用于疾病標(biāo)志物驗證、藥物機(jī)制研究等領(lǐng)域，二者核心原理相通，差異在于PRM支持更靈活的多離子同步檢測。
一、核心邏輯：靶向離子精準(zhǔn)捕獲
技術(shù)核心是對目標(biāo)蛋白的“特征肽段-特征碎片離子”特異性監(jiān)測，排除基質(zhì)干擾：
特征肽段篩選：為每種蛋白選1-3條特異性酶解肽段（多為8-20個氨基酸的胰蛋白酶解肽段），需無同源交叉反應(yīng)、易電離且穩(wěn)定（避開易氧化氨基酸），如檢測血清白蛋白可選特定序列肽段確保識別特異。
MRM離子監(jiān)測：分三步篩選——一級質(zhì)譜（MS1）鎖定特征肽段母離子（按質(zhì)荷比m/z）；母離子進(jìn)入碰撞池經(jīng)碰撞誘導(dǎo)解離（CID）生成子離子；二級質(zhì)譜（MS2）僅監(jiān)測該肽段有的1-2個子離子，通過子離子信號強(qiáng)度推算蛋白含量。
PRM技術(shù)升級：在MRM基礎(chǔ)上實現(xiàn)“平行監(jiān)測”，一次檢測同時選多種肽段母離子，碎裂后二級質(zhì)譜全掃描所有子離子，既保留特異性，又能通過子離子譜圖驗證肽段身份，降低假陽性，適配多蛋白同步定量。
二、關(guān)鍵流程：從樣本到定量
樣本預(yù)處理：提取樣本總蛋白后純化去雜質(zhì)，低豐度蛋白需富集；用胰蛋白酶酶解蛋白生成肽段，脫鹽后添加穩(wěn)定同位素內(nèi)標(biāo)肽段（與目標(biāo)肽段化學(xué)性質(zhì)一致、質(zhì)量有差異），消除檢測系統(tǒng)誤差。
質(zhì)譜檢測：肽段先經(jīng)高效液相色譜分離（按疏水性洗脫，避免離子抑制）；MRM需預(yù)設(shè)“母離子-子離子”參數(shù)，捕獲母離子碎裂后監(jiān)測特定子離子；PRM則同步選多母離子，高分辨率全掃子離子，提取信號定量。
數(shù)據(jù)分析：以內(nèi)標(biāo)肽段峰面積為參照，算目標(biāo)肽段與內(nèi)標(biāo)的峰面積比，結(jié)合內(nèi)標(biāo)濃度和標(biāo)準(zhǔn)曲線推肽段濃度，再按蛋白與肽段摩爾比算蛋白絕對含量；需驗證保留時間變異系數(shù)≤5%、峰面積變異系數(shù)≤10%，確保結(jié)果可靠。
三、技術(shù)優(yōu)勢
高特異性：“母離子-子離子”雙重篩選，排除雜質(zhì)干擾，低至pg/mL級的目標(biāo)蛋白也能精準(zhǔn)識別，假陽性率遠(yuǎn)低于非靶向技術(shù)。
高靈敏與寬動態(tài)：結(jié)合富集與高分辨質(zhì)譜，檢測限達(dá)fmol級，定量范圍覆蓋6-8個數(shù)量級，適配高低豐度蛋白檢測。
可重復(fù)與標(biāo)準(zhǔn)化：檢測參數(shù)可標(biāo)準(zhǔn)化，不同實驗室結(jié)果一致性高，是MRM/PRM定量蛋白組學(xué)分析從“發(fā)現(xiàn)”到“驗證”的關(guān)鍵技術(shù)，為生命科學(xué)研究與臨床轉(zhuǎn)化提供可靠定量工具。
