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選擇SNP分型服務(wù),可根據(jù)實驗規(guī)模決定。PCR-LDR技術(shù)適用于中低通量檢測,能精準(zhǔn)滿足小規(guī)模實驗需求;基于二代測序的Hi-SNP技術(shù)則適合高通量檢測,為大規(guī)模實驗提供高效方案。
1. PCR-LDR技術(shù)技術(shù)路線:

2. 分型流程
a. 位點評估:確認(rèn)物種,基因或序列信息,對SNP位點的同源性(高同源不適合該方法檢測SNP,本公司有針對該狀況的特色服務(wù)),GC含量(含量過高可能導(dǎo)致檢測失?。┑冗M(jìn)行評估,確定可行性。
b. 樣本質(zhì)控:電泳及濃度綜合質(zhì)控,不合格的樣本反饋給客戶。單管操作,樣本消耗量少,100ng樣本就能做幾十上百個SNP。
c. 引物設(shè)計合成:根據(jù)擴(kuò)增子設(shè)計并合成引物。
d. 擴(kuò)增階段:調(diào)整各對引物的體積及反應(yīng)條件,使得每對引物的擴(kuò)增效率相當(dāng),同時擴(kuò)增多個目標(biāo)DNA片段。
e. LDR及電泳:擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行連接酶檢測反應(yīng),反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳分離。
f. 數(shù)據(jù)分析:分析熒光峰位置及片段大小,確定基因型。生成實驗報告。
3. 技術(shù)核心
連接酶檢測反應(yīng)(LDR)

PCR-LDR-SNP分型系統(tǒng)

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