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上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司
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翼和SNP分型技術(shù)(二):Hi-SNP技術(shù)

時間:2025/11/5閱讀:326
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選擇SNP分型服務(wù),可根據(jù)實驗規(guī)模決定。PCR-LDR技術(shù)適用于中低通量檢測,能精準(zhǔn)滿足小規(guī)模實驗需求;基于二代測序的Hi-SNP技術(shù)則適合高通量檢測,為大規(guī)模實驗提供高效方案。

1. Hi-SNP分型服務(wù)技術(shù)路線:

圖片1.png

 

2. 分型流程

a. 位點評估:確認(rèn)物種,版本,基因或序列信息,對SNP位點的同源性,(高同源不適合該方法檢測SNP,本公司有針對該狀況的特色服務(wù)),GC含量(含量過高可能導(dǎo)致檢測失?。┑冗M(jìn)行評估,確定可行性。

b. 樣本質(zhì)控:電泳及濃度綜合質(zhì)控,不合格的樣本反饋給客戶。單管操作,樣本消耗量少,100ng樣本就能做幾十上百個SNP。

c. 引物設(shè)計合成:根據(jù)擴(kuò)增子設(shè)計并合成引物。

d. 擴(kuò)增階段:調(diào)整各對引物的體積及反應(yīng)條件,使得每對引物的擴(kuò)增效率相當(dāng),同時擴(kuò)增多個目標(biāo)DNA片段。

e. 樣本建庫:根據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行建庫,加測序接頭,用不同barcode來區(qū)分,為測序做準(zhǔn)備。

f. 測序及數(shù)據(jù)分析:在illumina novaseq pe150 平臺上,對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序,然后對測序結(jié)果進(jìn)行分析,出率不足的(95%以上)要補(bǔ)數(shù)據(jù)。完成實驗報告。

 

3. 翼和特色

● 自主知識產(chǎn)權(quán)的多重PCR為基礎(chǔ),技術(shù)先進(jìn),結(jié)果準(zhǔn)確

● 通量高,SNP位點30-500個之間,數(shù)百數(shù)千樣本推薦使用

● 平均測序深度1000倍,每個SNP位點測序深度至少幾百倍

● 適用性廣,適用于任何多態(tài)性位點

● 對SNP位點以及周圍序列進(jìn)行測序,更準(zhǔn)確,更靈敏

● 測序質(zhì)量Q30>90%

● 檢出率95%以上

● 準(zhǔn)確率>98%

 

 


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